Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf1cQ6PDZ2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf1cQ6PDZ2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf1cQ6PDZ2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf1cQ6PDZ2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf1cQ6PDZ2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf1cQ6PDZ2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf1cQ6PDZ2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf1cQ6PDZ2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf1cQ6PDZ2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf1cQ6PDZ2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf1cQ6PDZ2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf1cQ6PDZ2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf1cQ6PDZ2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf1cQ6PDZ2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf1cQ6PDZ2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf1cQ6PDZ2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf1cQ6PDZ2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Taf1cQ6PDZ2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf1cQ6PDZ2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf1cQ6PDZ2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf1cQ6PDZ2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf1cQ6PDZ2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf1cQ6PDZ2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf1cQ6PDZ2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf1cQ6PDZ2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf1cQ6PDZ2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf1cQ6PDZ2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf1cQ6PDZ2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf1cQ6PDZ2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf1cQ6PDZ2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Taf1cQ6PDZ2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Taf1cQ6PDZ2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf1cQ6PDZ2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms