Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC8

Mfsd4a, Major facilitator superfamily domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4aQ6PDC8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mfsd4aQ6PDC8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Mfsd4aQ6PDC8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Mfsd4aQ6PDC8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mfsd4aQ6PDC8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mfsd4aQ6PDC8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mfsd4aQ6PDC8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mfsd4aQ6PDC8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mfsd4aQ6PDC8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mfsd4aQ6PDC8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mfsd4aQ6PDC8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mfsd4aQ6PDC8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mfsd4aQ6PDC8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mfsd4aQ6PDC8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Mfsd4aQ6PDC8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mfsd4aQ6PDC8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mfsd4aQ6PDC8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mfsd4aQ6PDC8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mfsd4aQ6PDC8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mfsd4aQ6PDC8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mfsd4aQ6PDC8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mfsd4aQ6PDC8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mfsd4aQ6PDC8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mfsd4aQ6PDC8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms