Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB60

Bhlhb9, Protein BHLHb9, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhb9Q6PB60 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bhlhb9Q6PB60 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bhlhb9Q6PB60 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms