Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg2aQ6P4T0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg2aQ6P4T0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg2aQ6P4T0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg2aQ6P4T0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg2aQ6P4T0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg2aQ6P4T0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg2aQ6P4T0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg2aQ6P4T0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atg2aQ6P4T0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg2aQ6P4T0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg2aQ6P4T0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg2aQ6P4T0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg2aQ6P4T0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg2aQ6P4T0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg2aQ6P4T0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg2aQ6P4T0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg2aQ6P4T0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg2aQ6P4T0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg2aQ6P4T0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg2aQ6P4T0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg2aQ6P4T0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg2aQ6P4T0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg2aQ6P4T0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg2aQ6P4T0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg2aQ6P4T0 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg2aQ6P4T0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg2aQ6P4T0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg2aQ6P4T0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atg2aQ6P4T0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atg2aQ6P4T0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atg2aQ6P4T0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atg2aQ6P4T0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg2aQ6P4T0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg2aQ6P4T0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg2aQ6P4T0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg2aQ6P4T0 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg2aQ6P4T0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg2aQ6P4T0 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg2aQ6P4T0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg2aQ6P4T0 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg2aQ6P4T0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg2aQ6P4T0 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg2aQ6P4T0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg2aQ6P4T0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atg2aQ6P4T0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg2aQ6P4T0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg2aQ6P4T0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg2aQ6P4T0 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg2aQ6P4T0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg2aQ6P4T0 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg2aQ6P4T0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg2aQ6P4T0 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg2aQ6P4T0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg2aQ6P4T0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg2aQ6P4T0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg2aQ6P4T0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg2aQ6P4T0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg2aQ6P4T0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg2aQ6P4T0 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg2aQ6P4T0 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atg2aQ6P4T0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg2aQ6P4T0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg2aQ6P4T0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg2aQ6P4T0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg2aQ6P4T0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg2aQ6P4T0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg2aQ6P4T0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg2aQ6P4T0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg2aQ6P4T0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atg2aQ6P4T0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg2aQ6P4T0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg2aQ6P4T0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg2aQ6P4T0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg2aQ6P4T0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg2aQ6P4T0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg2aQ6P4T0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg2aQ6P4T0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg2aQ6P4T0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg2aQ6P4T0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg2aQ6P4T0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg2aQ6P4T0 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg2aQ6P4T0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atg2aQ6P4T0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg2aQ6P4T0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg2aQ6P4T0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg2aQ6P4T0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg2aQ6P4T0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg2aQ6P4T0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg2aQ6P4T0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg2aQ6P4T0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg2aQ6P4T0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atg2aQ6P4T0 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg2aQ6P4T0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg2aQ6P4T0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg2aQ6P4T0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg2aQ6P4T0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg2aQ6P4T0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg2aQ6P4T0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Atg2aQ6P4T0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms