Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1G2

Kdm2b, Lysine-specific demethylase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm2bQ6P1G2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kdm2bQ6P1G2 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Kdm2bQ6P1G2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kdm2bQ6P1G2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kdm2bQ6P1G2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kdm2bQ6P1G2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kdm2bQ6P1G2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kdm2bQ6P1G2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kdm2bQ6P1G2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kdm2bQ6P1G2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kdm2bQ6P1G2 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kdm2bQ6P1G2 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kdm2bQ6P1G2 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kdm2bQ6P1G2 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kdm2bQ6P1G2 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kdm2bQ6P1G2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kdm2bQ6P1G2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kdm2bQ6P1G2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kdm2bQ6P1G2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kdm2bQ6P1G2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kdm2bQ6P1G2 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kdm2bQ6P1G2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kdm2bQ6P1G2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kdm2bQ6P1G2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kdm2bQ6P1G2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kdm2bQ6P1G2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kdm2bQ6P1G2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kdm2bQ6P1G2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kdm2bQ6P1G2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kdm2bQ6P1G2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kdm2bQ6P1G2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kdm2bQ6P1G2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kdm2bQ6P1G2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kdm2bQ6P1G2 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kdm2bQ6P1G2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kdm2bQ6P1G2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kdm2bQ6P1G2 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Kdm2bQ6P1G2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kdm2bQ6P1G2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kdm2bQ6P1G2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm2bQ6P1G2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm2bQ6P1G2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm2bQ6P1G2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm2bQ6P1G2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm2bQ6P1G2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm2bQ6P1G2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm2bQ6P1G2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm2bQ6P1G2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm2bQ6P1G2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm2bQ6P1G2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm2bQ6P1G2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm2bQ6P1G2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kdm2bQ6P1G2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kdm2bQ6P1G2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kdm2bQ6P1G2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kdm2bQ6P1G2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kdm2bQ6P1G2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kdm2bQ6P1G2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kdm2bQ6P1G2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kdm2bQ6P1G2 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kdm2bQ6P1G2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kdm2bQ6P1G2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Kdm2bQ6P1G2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kdm2bQ6P1G2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kdm2bQ6P1G2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kdm2bQ6P1G2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kdm2bQ6P1G2 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kdm2bQ6P1G2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm2bQ6P1G2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm2bQ6P1G2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm2bQ6P1G2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm2bQ6P1G2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm2bQ6P1G2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm2bQ6P1G2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm2bQ6P1G2 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm2bQ6P1G2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm2bQ6P1G2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm2bQ6P1G2 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Kdm2bQ6P1G2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm2bQ6P1G2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm2bQ6P1G2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm2bQ6P1G2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm2bQ6P1G2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kdm2bQ6P1G2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kdm2bQ6P1G2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kdm2bQ6P1G2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kdm2bQ6P1G2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kdm2bQ6P1G2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kdm2bQ6P1G2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kdm2bQ6P1G2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kdm2bQ6P1G2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Kdm2bQ6P1G2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kdm2bQ6P1G2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kdm2bQ6P1G2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kdm2bQ6P1G2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kdm2bQ6P1G2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kdm2bQ6P1G2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kdm2bQ6P1G2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Kdm2bQ6P1G2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kdm2bQ6P1G2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms