Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Slx4Q6P1D7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Slx4Q6P1D7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Slx4Q6P1D7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Slx4Q6P1D7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Slx4Q6P1D7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Slx4Q6P1D7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Slx4Q6P1D7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Slx4Q6P1D7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Slx4Q6P1D7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Slx4Q6P1D7 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Slx4Q6P1D7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Slx4Q6P1D7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Slx4Q6P1D7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Slx4Q6P1D7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Slx4Q6P1D7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Slx4Q6P1D7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Slx4Q6P1D7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Slx4Q6P1D7 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Slx4Q6P1D7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Slx4Q6P1D7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Slx4Q6P1D7 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Slx4Q6P1D7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Slx4Q6P1D7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Slx4Q6P1D7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Slx4Q6P1D7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Slx4Q6P1D7 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Slx4Q6P1D7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Slx4Q6P1D7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Slx4Q6P1D7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Slx4Q6P1D7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Slx4Q6P1D7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Slx4Q6P1D7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Slx4Q6P1D7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Slx4Q6P1D7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Slx4Q6P1D7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Slx4Q6P1D7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Slx4Q6P1D7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Slx4Q6P1D7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Slx4Q6P1D7 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Slx4Q6P1D7 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Slx4Q6P1D7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Slx4Q6P1D7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Slx4Q6P1D7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Slx4Q6P1D7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Slx4Q6P1D7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Slx4Q6P1D7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Slx4Q6P1D7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Slx4Q6P1D7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Slx4Q6P1D7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Slx4Q6P1D7 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Slx4Q6P1D7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Slx4Q6P1D7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Slx4Q6P1D7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Slx4Q6P1D7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Slx4Q6P1D7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Slx4Q6P1D7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Slx4Q6P1D7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Slx4Q6P1D7 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Slx4Q6P1D7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Slx4Q6P1D7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Slx4Q6P1D7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Slx4Q6P1D7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Slx4Q6P1D7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Slx4Q6P1D7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Slx4Q6P1D7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Slx4Q6P1D7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Slx4Q6P1D7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Slx4Q6P1D7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Slx4Q6P1D7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Slx4Q6P1D7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Slx4Q6P1D7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Slx4Q6P1D7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Slx4Q6P1D7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Slx4Q6P1D7 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Slx4Q6P1D7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Slx4Q6P1D7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Slx4Q6P1D7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Slx4Q6P1D7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Slx4Q6P1D7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Slx4Q6P1D7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Slx4Q6P1D7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Slx4Q6P1D7 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Slx4Q6P1D7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Slx4Q6P1D7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Slx4Q6P1D7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Slx4Q6P1D7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Slx4Q6P1D7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Slx4Q6P1D7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Slx4Q6P1D7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Slx4Q6P1D7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Slx4Q6P1D7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Slx4Q6P1D7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Slx4Q6P1D7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Slx4Q6P1D7 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Slx4Q6P1D7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Slx4Q6P1D7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Slx4Q6P1D7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Slx4Q6P1D7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Slx4Q6P1D7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms