Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZN1

Pprc1, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,644 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pprc1Q6NZN1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pprc1Q6NZN1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pprc1Q6NZN1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pprc1Q6NZN1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pprc1Q6NZN1 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Pprc1Q6NZN1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pprc1Q6NZN1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pprc1Q6NZN1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pprc1Q6NZN1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pprc1Q6NZN1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Pprc1Q6NZN1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pprc1Q6NZN1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pprc1Q6NZN1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pprc1Q6NZN1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Pprc1Q6NZN1 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Pprc1Q6NZN1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pprc1Q6NZN1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pprc1Q6NZN1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pprc1Q6NZN1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pprc1Q6NZN1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pprc1Q6NZN1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pprc1Q6NZN1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pprc1Q6NZN1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pprc1Q6NZN1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pprc1Q6NZN1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Pprc1Q6NZN1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Pprc1Q6NZN1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Pprc1Q6NZN1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Pprc1Q6NZN1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Pprc1Q6NZN1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Pprc1Q6NZN1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Pprc1Q6NZN1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Pprc1Q6NZN1 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pprc1Q6NZN1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pprc1Q6NZN1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pprc1Q6NZN1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pprc1Q6NZN1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pprc1Q6NZN1 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Pprc1Q6NZN1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pprc1Q6NZN1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pprc1Q6NZN1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pprc1Q6NZN1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pprc1Q6NZN1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pprc1Q6NZN1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pprc1Q6NZN1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pprc1Q6NZN1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pprc1Q6NZN1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pprc1Q6NZN1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pprc1Q6NZN1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pprc1Q6NZN1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pprc1Q6NZN1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pprc1Q6NZN1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pprc1Q6NZN1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pprc1Q6NZN1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pprc1Q6NZN1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pprc1Q6NZN1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pprc1Q6NZN1 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pprc1Q6NZN1 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pprc1Q6NZN1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pprc1Q6NZN1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pprc1Q6NZN1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pprc1Q6NZN1 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pprc1Q6NZN1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pprc1Q6NZN1 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pprc1Q6NZN1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pprc1Q6NZN1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pprc1Q6NZN1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pprc1Q6NZN1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pprc1Q6NZN1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pprc1Q6NZN1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pprc1Q6NZN1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pprc1Q6NZN1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pprc1Q6NZN1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pprc1Q6NZN1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pprc1Q6NZN1 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pprc1Q6NZN1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pprc1Q6NZN1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pprc1Q6NZN1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Pprc1Q6NZN1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pprc1Q6NZN1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pprc1Q6NZN1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pprc1Q6NZN1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Pprc1Q6NZN1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Pprc1Q6NZN1 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Pprc1Q6NZN1 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Pprc1Q6NZN1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Pprc1Q6NZN1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Pprc1Q6NZN1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Pprc1Q6NZN1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Pprc1Q6NZN1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Pprc1Q6NZN1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Pprc1Q6NZN1 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pprc1Q6NZN1 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pprc1Q6NZN1 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Pprc1Q6NZN1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pprc1Q6NZN1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pprc1Q6NZN1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pprc1Q6NZN1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pprc1Q6NZN1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Pprc1Q6NZN1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms