Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWW9

Fndc3b, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3bQ6NWW9 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fndc3bQ6NWW9 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fndc3bQ6NWW9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fndc3bQ6NWW9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fndc3bQ6NWW9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fndc3bQ6NWW9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fndc3bQ6NWW9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fndc3bQ6NWW9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fndc3bQ6NWW9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fndc3bQ6NWW9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fndc3bQ6NWW9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fndc3bQ6NWW9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fndc3bQ6NWW9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fndc3bQ6NWW9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fndc3bQ6NWW9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fndc3bQ6NWW9 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Fndc3bQ6NWW9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fndc3bQ6NWW9 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fndc3bQ6NWW9 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fndc3bQ6NWW9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fndc3bQ6NWW9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fndc3bQ6NWW9 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Fndc3bQ6NWW9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fndc3bQ6NWW9 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fndc3bQ6NWW9 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fndc3bQ6NWW9 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fndc3bQ6NWW9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fndc3bQ6NWW9 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fndc3bQ6NWW9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Fndc3bQ6NWW9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fndc3bQ6NWW9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fndc3bQ6NWW9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fndc3bQ6NWW9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fndc3bQ6NWW9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fndc3bQ6NWW9 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fndc3bQ6NWW9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fndc3bQ6NWW9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Fndc3bQ6NWW9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fndc3bQ6NWW9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fndc3bQ6NWW9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fndc3bQ6NWW9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fndc3bQ6NWW9 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fndc3bQ6NWW9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Fndc3bQ6NWW9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fndc3bQ6NWW9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fndc3bQ6NWW9 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fndc3bQ6NWW9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fndc3bQ6NWW9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fndc3bQ6NWW9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fndc3bQ6NWW9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fndc3bQ6NWW9 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fndc3bQ6NWW9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fndc3bQ6NWW9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fndc3bQ6NWW9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fndc3bQ6NWW9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Fndc3bQ6NWW9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fndc3bQ6NWW9 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fndc3bQ6NWW9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fndc3bQ6NWW9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fndc3bQ6NWW9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fndc3bQ6NWW9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fndc3bQ6NWW9 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fndc3bQ6NWW9 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fndc3bQ6NWW9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fndc3bQ6NWW9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fndc3bQ6NWW9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fndc3bQ6NWW9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fndc3bQ6NWW9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fndc3bQ6NWW9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fndc3bQ6NWW9 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fndc3bQ6NWW9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Fndc3bQ6NWW9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fndc3bQ6NWW9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fndc3bQ6NWW9 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fndc3bQ6NWW9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fndc3bQ6NWW9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fndc3bQ6NWW9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fndc3bQ6NWW9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fndc3bQ6NWW9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fndc3bQ6NWW9 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fndc3bQ6NWW9 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fndc3bQ6NWW9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fndc3bQ6NWW9 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fndc3bQ6NWW9 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fndc3bQ6NWW9 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fndc3bQ6NWW9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Fndc3bQ6NWW9 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fndc3bQ6NWW9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fndc3bQ6NWW9 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fndc3bQ6NWW9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fndc3bQ6NWW9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fndc3bQ6NWW9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fndc3bQ6NWW9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fndc3bQ6NWW9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fndc3bQ6NWW9 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fndc3bQ6NWW9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fndc3bQ6NWW9 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Fndc3bQ6NWW9 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Fndc3bQ6NWW9 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fndc3bQ6NWW9 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms