Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pdcd11Q6NS46 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Pdcd11Q6NS46 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pdcd11Q6NS46 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pdcd11Q6NS46 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pdcd11Q6NS46 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pdcd11Q6NS46 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pdcd11Q6NS46 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pdcd11Q6NS46 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pdcd11Q6NS46 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pdcd11Q6NS46 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pdcd11Q6NS46 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Pdcd11Q6NS46 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pdcd11Q6NS46 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pdcd11Q6NS46 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pdcd11Q6NS46 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pdcd11Q6NS46 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pdcd11Q6NS46 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pdcd11Q6NS46 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pdcd11Q6NS46 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pdcd11Q6NS46 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pdcd11Q6NS46 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pdcd11Q6NS46 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pdcd11Q6NS46 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pdcd11Q6NS46 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pdcd11Q6NS46 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pdcd11Q6NS46 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pdcd11Q6NS46 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pdcd11Q6NS46 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pdcd11Q6NS46 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pdcd11Q6NS46 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pdcd11Q6NS46 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pdcd11Q6NS46 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pdcd11Q6NS46 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pdcd11Q6NS46 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pdcd11Q6NS46 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Pdcd11Q6NS46 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Pdcd11Q6NS46 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Pdcd11Q6NS46 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Pdcd11Q6NS46 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
Pdcd11Q6NS46 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pdcd11Q6NS46 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pdcd11Q6NS46 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pdcd11Q6NS46 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pdcd11Q6NS46 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pdcd11Q6NS46 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pdcd11Q6NS46 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pdcd11Q6NS46 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pdcd11Q6NS46 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Pdcd11Q6NS46 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pdcd11Q6NS46 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pdcd11Q6NS46 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pdcd11Q6NS46 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pdcd11Q6NS46 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pdcd11Q6NS46 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pdcd11Q6NS46 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pdcd11Q6NS46 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pdcd11Q6NS46 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pdcd11Q6NS46 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Pdcd11Q6NS46 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Pdcd11Q6NS46 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pdcd11Q6NS46 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pdcd11Q6NS46 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pdcd11Q6NS46 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pdcd11Q6NS46 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pdcd11Q6NS46 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Pdcd11Q6NS46 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pdcd11Q6NS46 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Pdcd11Q6NS46 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Pdcd11Q6NS46 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pdcd11Q6NS46 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pdcd11Q6NS46 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pdcd11Q6NS46 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pdcd11Q6NS46 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Pdcd11Q6NS46 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pdcd11Q6NS46 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pdcd11Q6NS46 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pdcd11Q6NS46 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pdcd11Q6NS46 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pdcd11Q6NS46 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pdcd11Q6NS46 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pdcd11Q6NS46 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pdcd11Q6NS46 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pdcd11Q6NS46 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pdcd11Q6NS46 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pdcd11Q6NS46 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pdcd11Q6NS46 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Pdcd11Q6NS46 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pdcd11Q6NS46 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pdcd11Q6NS46 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Pdcd11Q6NS46 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pdcd11Q6NS46 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pdcd11Q6NS46 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pdcd11Q6NS46 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pdcd11Q6NS46 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pdcd11Q6NS46 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pdcd11Q6NS46 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pdcd11Q6NS46 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Pdcd11Q6NS46 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Pdcd11Q6NS46 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms