Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scaf8Q6DID3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scaf8Q6DID3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Scaf8Q6DID3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scaf8Q6DID3 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scaf8Q6DID3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scaf8Q6DID3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scaf8Q6DID3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scaf8Q6DID3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scaf8Q6DID3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scaf8Q6DID3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scaf8Q6DID3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scaf8Q6DID3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scaf8Q6DID3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scaf8Q6DID3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scaf8Q6DID3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scaf8Q6DID3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scaf8Q6DID3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scaf8Q6DID3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scaf8Q6DID3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scaf8Q6DID3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scaf8Q6DID3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Scaf8Q6DID3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scaf8Q6DID3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scaf8Q6DID3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scaf8Q6DID3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scaf8Q6DID3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scaf8Q6DID3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scaf8Q6DID3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scaf8Q6DID3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scaf8Q6DID3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scaf8Q6DID3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scaf8Q6DID3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scaf8Q6DID3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scaf8Q6DID3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scaf8Q6DID3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Scaf8Q6DID3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Scaf8Q6DID3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Scaf8Q6DID3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Scaf8Q6DID3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Scaf8Q6DID3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Scaf8Q6DID3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Scaf8Q6DID3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scaf8Q6DID3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scaf8Q6DID3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scaf8Q6DID3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scaf8Q6DID3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scaf8Q6DID3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scaf8Q6DID3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scaf8Q6DID3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scaf8Q6DID3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scaf8Q6DID3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scaf8Q6DID3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scaf8Q6DID3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scaf8Q6DID3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scaf8Q6DID3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scaf8Q6DID3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scaf8Q6DID3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scaf8Q6DID3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scaf8Q6DID3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scaf8Q6DID3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scaf8Q6DID3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scaf8Q6DID3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scaf8Q6DID3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Scaf8Q6DID3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Scaf8Q6DID3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Scaf8Q6DID3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Scaf8Q6DID3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Scaf8Q6DID3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Scaf8Q6DID3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Scaf8Q6DID3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Scaf8Q6DID3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Scaf8Q6DID3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Scaf8Q6DID3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Scaf8Q6DID3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Scaf8Q6DID3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Scaf8Q6DID3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Scaf8Q6DID3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Scaf8Q6DID3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Scaf8Q6DID3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Scaf8Q6DID3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Scaf8Q6DID3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Scaf8Q6DID3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Scaf8Q6DID3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Scaf8Q6DID3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Scaf8Q6DID3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Scaf8Q6DID3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Scaf8Q6DID3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Scaf8Q6DID3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scaf8Q6DID3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scaf8Q6DID3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scaf8Q6DID3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scaf8Q6DID3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scaf8Q6DID3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scaf8Q6DID3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scaf8Q6DID3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Scaf8Q6DID3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Scaf8Q6DID3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Scaf8Q6DID3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Scaf8Q6DID3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms