Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIA9

Fbxo27, F-box only protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo27Q6DIA9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo27Q6DIA9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fbxo27Q6DIA9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fbxo27Q6DIA9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fbxo27Q6DIA9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fbxo27Q6DIA9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fbxo27Q6DIA9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fbxo27Q6DIA9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fbxo27Q6DIA9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fbxo27Q6DIA9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fbxo27Q6DIA9 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Fbxo27Q6DIA9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fbxo27Q6DIA9 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Fbxo27Q6DIA9 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fbxo27Q6DIA9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fbxo27Q6DIA9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fbxo27Q6DIA9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo27Q6DIA9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo27Q6DIA9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo27Q6DIA9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo27Q6DIA9 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo27Q6DIA9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo27Q6DIA9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo27Q6DIA9 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo27Q6DIA9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo27Q6DIA9 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo27Q6DIA9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo27Q6DIA9 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo27Q6DIA9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo27Q6DIA9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo27Q6DIA9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo27Q6DIA9 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo27Q6DIA9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo27Q6DIA9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo27Q6DIA9 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo27Q6DIA9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo27Q6DIA9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo27Q6DIA9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo27Q6DIA9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo27Q6DIA9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo27Q6DIA9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo27Q6DIA9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo27Q6DIA9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo27Q6DIA9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo27Q6DIA9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo27Q6DIA9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo27Q6DIA9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo27Q6DIA9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo27Q6DIA9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo27Q6DIA9 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo27Q6DIA9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo27Q6DIA9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo27Q6DIA9 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo27Q6DIA9 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo27Q6DIA9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo27Q6DIA9 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo27Q6DIA9 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo27Q6DIA9 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo27Q6DIA9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo27Q6DIA9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo27Q6DIA9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo27Q6DIA9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo27Q6DIA9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo27Q6DIA9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo27Q6DIA9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo27Q6DIA9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo27Q6DIA9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo27Q6DIA9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo27Q6DIA9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo27Q6DIA9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo27Q6DIA9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo27Q6DIA9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo27Q6DIA9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo27Q6DIA9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo27Q6DIA9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo27Q6DIA9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo27Q6DIA9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo27Q6DIA9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo27Q6DIA9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo27Q6DIA9 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo27Q6DIA9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo27Q6DIA9 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo27Q6DIA9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo27Q6DIA9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo27Q6DIA9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo27Q6DIA9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo27Q6DIA9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo27Q6DIA9 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo27Q6DIA9 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms