Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q6DFW0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q6DFW0 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Q6DFW0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q6DFW0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q6DFW0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q6DFW0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q6DFW0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q6DFW0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q6DFW0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q6DFW0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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