Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdzrn3Q69ZS0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdzrn3Q69ZS0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdzrn3Q69ZS0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdzrn3Q69ZS0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdzrn3Q69ZS0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdzrn3Q69ZS0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdzrn3Q69ZS0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdzrn3Q69ZS0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdzrn3Q69ZS0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdzrn3Q69ZS0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdzrn3Q69ZS0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdzrn3Q69ZS0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdzrn3Q69ZS0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdzrn3Q69ZS0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdzrn3Q69ZS0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdzrn3Q69ZS0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdzrn3Q69ZS0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdzrn3Q69ZS0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdzrn3Q69ZS0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdzrn3Q69ZS0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdzrn3Q69ZS0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdzrn3Q69ZS0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdzrn3Q69ZS0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdzrn3Q69ZS0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdzrn3Q69ZS0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdzrn3Q69ZS0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdzrn3Q69ZS0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdzrn3Q69ZS0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdzrn3Q69ZS0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdzrn3Q69ZS0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdzrn3Q69ZS0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdzrn3Q69ZS0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdzrn3Q69ZS0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdzrn3Q69ZS0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdzrn3Q69ZS0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdzrn3Q69ZS0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdzrn3Q69ZS0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdzrn3Q69ZS0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdzrn3Q69ZS0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdzrn3Q69ZS0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdzrn3Q69ZS0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdzrn3Q69ZS0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdzrn3Q69ZS0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdzrn3Q69ZS0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdzrn3Q69ZS0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdzrn3Q69ZS0 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdzrn3Q69ZS0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdzrn3Q69ZS0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdzrn3Q69ZS0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdzrn3Q69ZS0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdzrn3Q69ZS0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdzrn3Q69ZS0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdzrn3Q69ZS0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdzrn3Q69ZS0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdzrn3Q69ZS0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdzrn3Q69ZS0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdzrn3Q69ZS0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdzrn3Q69ZS0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdzrn3Q69ZS0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdzrn3Q69ZS0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdzrn3Q69ZS0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdzrn3Q69ZS0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdzrn3Q69ZS0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdzrn3Q69ZS0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdzrn3Q69ZS0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdzrn3Q69ZS0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdzrn3Q69ZS0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdzrn3Q69ZS0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdzrn3Q69ZS0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdzrn3Q69ZS0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdzrn3Q69ZS0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdzrn3Q69ZS0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdzrn3Q69ZS0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdzrn3Q69ZS0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdzrn3Q69ZS0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdzrn3Q69ZS0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdzrn3Q69ZS0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdzrn3Q69ZS0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdzrn3Q69ZS0 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdzrn3Q69ZS0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdzrn3Q69ZS0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdzrn3Q69ZS0 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdzrn3Q69ZS0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdzrn3Q69ZS0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdzrn3Q69ZS0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdzrn3Q69ZS0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdzrn3Q69ZS0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdzrn3Q69ZS0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdzrn3Q69ZS0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdzrn3Q69ZS0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
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