Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cntn4Q69Z26 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntn4Q69Z26 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms