Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG3

Spty2d1, Protein SPT2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spty2d1Q68FG3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spty2d1Q68FG3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Spty2d1Q68FG3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Spty2d1Q68FG3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Spty2d1Q68FG3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Spty2d1Q68FG3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Spty2d1Q68FG3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spty2d1Q68FG3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Spty2d1Q68FG3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Spty2d1Q68FG3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spty2d1Q68FG3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spty2d1Q68FG3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Spty2d1Q68FG3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spty2d1Q68FG3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Spty2d1Q68FG3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Spty2d1Q68FG3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spty2d1Q68FG3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Spty2d1Q68FG3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spty2d1Q68FG3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Spty2d1Q68FG3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spty2d1Q68FG3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spty2d1Q68FG3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Spty2d1Q68FG3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spty2d1Q68FG3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spty2d1Q68FG3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spty2d1Q68FG3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spty2d1Q68FG3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Spty2d1Q68FG3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Spty2d1Q68FG3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spty2d1Q68FG3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spty2d1Q68FG3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spty2d1Q68FG3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spty2d1Q68FG3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spty2d1Q68FG3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Spty2d1Q68FG3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spty2d1Q68FG3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Spty2d1Q68FG3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spty2d1Q68FG3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spty2d1Q68FG3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Spty2d1Q68FG3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms