Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF0

Rab3ip, Rab-3A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3ipQ68EF0 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab3ipQ68EF0 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab3ipQ68EF0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab3ipQ68EF0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab3ipQ68EF0 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab3ipQ68EF0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab3ipQ68EF0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab3ipQ68EF0 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab3ipQ68EF0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab3ipQ68EF0 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab3ipQ68EF0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab3ipQ68EF0 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab3ipQ68EF0 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab3ipQ68EF0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab3ipQ68EF0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab3ipQ68EF0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab3ipQ68EF0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab3ipQ68EF0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab3ipQ68EF0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab3ipQ68EF0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab3ipQ68EF0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab3ipQ68EF0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab3ipQ68EF0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab3ipQ68EF0 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab3ipQ68EF0 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab3ipQ68EF0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab3ipQ68EF0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab3ipQ68EF0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab3ipQ68EF0 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab3ipQ68EF0 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab3ipQ68EF0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab3ipQ68EF0 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab3ipQ68EF0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms