Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sbno1Q689Z5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sbno1Q689Z5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sbno1Q689Z5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sbno1Q689Z5 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sbno1Q689Z5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sbno1Q689Z5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Sbno1Q689Z5 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sbno1Q689Z5 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sbno1Q689Z5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Sbno1Q689Z5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sbno1Q689Z5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sbno1Q689Z5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sbno1Q689Z5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sbno1Q689Z5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sbno1Q689Z5 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Sbno1Q689Z5 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sbno1Q689Z5 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sbno1Q689Z5 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sbno1Q689Z5 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sbno1Q689Z5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sbno1Q689Z5 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sbno1Q689Z5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sbno1Q689Z5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sbno1Q689Z5 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sbno1Q689Z5 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sbno1Q689Z5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sbno1Q689Z5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sbno1Q689Z5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Sbno1Q689Z5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sbno1Q689Z5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sbno1Q689Z5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sbno1Q689Z5 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sbno1Q689Z5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sbno1Q689Z5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sbno1Q689Z5 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Sbno1Q689Z5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Sbno1Q689Z5 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sbno1Q689Z5 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sbno1Q689Z5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sbno1Q689Z5 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sbno1Q689Z5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sbno1Q689Z5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sbno1Q689Z5 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Sbno1Q689Z5 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Sbno1Q689Z5 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Sbno1Q689Z5 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sbno1Q689Z5 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sbno1Q689Z5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Sbno1Q689Z5 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Sbno1Q689Z5 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sbno1Q689Z5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Sbno1Q689Z5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sbno1Q689Z5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sbno1Q689Z5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Sbno1Q689Z5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Sbno1Q689Z5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Sbno1Q689Z5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sbno1Q689Z5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sbno1Q689Z5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sbno1Q689Z5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sbno1Q689Z5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sbno1Q689Z5 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sbno1Q689Z5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sbno1Q689Z5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sbno1Q689Z5 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sbno1Q689Z5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sbno1Q689Z5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Sbno1Q689Z5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sbno1Q689Z5 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sbno1Q689Z5 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Sbno1Q689Z5 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sbno1Q689Z5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sbno1Q689Z5 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sbno1Q689Z5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sbno1Q689Z5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sbno1Q689Z5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sbno1Q689Z5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sbno1Q689Z5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sbno1Q689Z5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sbno1Q689Z5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Sbno1Q689Z5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sbno1Q689Z5 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sbno1Q689Z5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sbno1Q689Z5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sbno1Q689Z5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sbno1Q689Z5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sbno1Q689Z5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sbno1Q689Z5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Sbno1Q689Z5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sbno1Q689Z5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sbno1Q689Z5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sbno1Q689Z5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sbno1Q689Z5 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sbno1Q689Z5 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sbno1Q689Z5 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sbno1Q689Z5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sbno1Q689Z5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sbno1Q689Z5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sbno1Q689Z5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms