Protein–RNA interactions for Protein: Q66K08

Cilp, Cartilage intermediate layer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CilpQ66K08 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CilpQ66K08 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CilpQ66K08 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CilpQ66K08 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CilpQ66K08 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CilpQ66K08 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CilpQ66K08 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CilpQ66K08 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CilpQ66K08 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CilpQ66K08 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CilpQ66K08 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CilpQ66K08 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CilpQ66K08 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CilpQ66K08 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CilpQ66K08 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CilpQ66K08 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CilpQ66K08 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CilpQ66K08 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CilpQ66K08 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CilpQ66K08 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CilpQ66K08 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CilpQ66K08 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CilpQ66K08 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CilpQ66K08 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CilpQ66K08 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CilpQ66K08 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CilpQ66K08 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CilpQ66K08 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CilpQ66K08 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CilpQ66K08 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CilpQ66K08 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CilpQ66K08 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CilpQ66K08 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CilpQ66K08 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CilpQ66K08 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CilpQ66K08 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CilpQ66K08 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CilpQ66K08 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CilpQ66K08 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CilpQ66K08 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CilpQ66K08 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CilpQ66K08 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CilpQ66K08 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CilpQ66K08 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CilpQ66K08 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CilpQ66K08 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CilpQ66K08 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CilpQ66K08 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CilpQ66K08 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CilpQ66K08 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CilpQ66K08 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CilpQ66K08 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CilpQ66K08 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CilpQ66K08 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CilpQ66K08 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms