Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC30.14■■■□□ 2.41
Top2bQ64511 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Top2bQ64511 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Top2bQ64511 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Top2bQ64511 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Top2bQ64511 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Top2bQ64511 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Top2bQ64511 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Top2bQ64511 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Top2bQ64511 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Top2bQ64511 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Top2bQ64511 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Top2bQ64511 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Top2bQ64511 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Top2bQ64511 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Top2bQ64511 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Top2bQ64511 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Top2bQ64511 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Top2bQ64511 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Top2bQ64511 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Top2bQ64511 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Top2bQ64511 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Top2bQ64511 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Top2bQ64511 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Top2bQ64511 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Top2bQ64511 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Top2bQ64511 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Top2bQ64511 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Top2bQ64511 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Top2bQ64511 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Top2bQ64511 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Top2bQ64511 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Top2bQ64511 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Top2bQ64511 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Top2bQ64511 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Top2bQ64511 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Top2bQ64511 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Top2bQ64511 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Top2bQ64511 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Top2bQ64511 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Top2bQ64511 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Top2bQ64511 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Top2bQ64511 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Top2bQ64511 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Top2bQ64511 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Top2bQ64511 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Top2bQ64511 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Top2bQ64511 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Top2bQ64511 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Top2bQ64511 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Top2bQ64511 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Top2bQ64511 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Top2bQ64511 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Top2bQ64511 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Top2bQ64511 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Top2bQ64511 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Top2bQ64511 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Top2bQ64511 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Top2bQ64511 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Top2bQ64511 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Top2bQ64511 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Top2bQ64511 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Top2bQ64511 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Top2bQ64511 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Top2bQ64511 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Top2bQ64511 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Top2bQ64511 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Top2bQ64511 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Top2bQ64511 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Top2bQ64511 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Top2bQ64511 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Top2bQ64511 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Top2bQ64511 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Top2bQ64511 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Top2bQ64511 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Top2bQ64511 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Top2bQ64511 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Top2bQ64511 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Top2bQ64511 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Top2bQ64511 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Top2bQ64511 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Top2bQ64511 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Top2bQ64511 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Top2bQ64511 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Top2bQ64511 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Top2bQ64511 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Top2bQ64511 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Top2bQ64511 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Top2bQ64511 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Top2bQ64511 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Top2bQ64511 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Top2bQ64511 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Top2bQ64511 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Top2bQ64511 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Top2bQ64511 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Top2bQ64511 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Top2bQ64511 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Top2bQ64511 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Top2bQ64511 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Top2bQ64511 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms