Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprdQ64487 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprdQ64487 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprdQ64487 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprdQ64487 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprdQ64487 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprdQ64487 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprdQ64487 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprdQ64487 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprdQ64487 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprdQ64487 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprdQ64487 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprdQ64487 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprdQ64487 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprdQ64487 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprdQ64487 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprdQ64487 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprdQ64487 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprdQ64487 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprdQ64487 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprdQ64487 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprdQ64487 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprdQ64487 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprdQ64487 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprdQ64487 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprdQ64487 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprdQ64487 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprdQ64487 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprdQ64487 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprdQ64487 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprdQ64487 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprdQ64487 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprdQ64487 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprdQ64487 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprdQ64487 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprdQ64487 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprdQ64487 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprdQ64487 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprdQ64487 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprdQ64487 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprdQ64487 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprdQ64487 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprdQ64487 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprdQ64487 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprdQ64487 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PtprdQ64487 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprdQ64487 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprdQ64487 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprdQ64487 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprdQ64487 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprdQ64487 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprdQ64487 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprdQ64487 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprdQ64487 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprdQ64487 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprdQ64487 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprdQ64487 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprdQ64487 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprdQ64487 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprdQ64487 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprdQ64487 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprdQ64487 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprdQ64487 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprdQ64487 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprdQ64487 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprdQ64487 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprdQ64487 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprdQ64487 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprdQ64487 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprdQ64487 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprdQ64487 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprdQ64487 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprdQ64487 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprdQ64487 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprdQ64487 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprdQ64487 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprdQ64487 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprdQ64487 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprdQ64487 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprdQ64487 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprdQ64487 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprdQ64487 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprdQ64487 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprdQ64487 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprdQ64487 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprdQ64487 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprdQ64487 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprdQ64487 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprdQ64487 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprdQ64487 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprdQ64487 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprdQ64487 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprdQ64487 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprdQ64487 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprdQ64487 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprdQ64487 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprdQ64487 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprdQ64487 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprdQ64487 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprdQ64487 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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