Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gja3Q64448 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gja3Q64448 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gja3Q64448 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gja3Q64448 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gja3Q64448 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Gja3Q64448 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gja3Q64448 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gja3Q64448 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gja3Q64448 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gja3Q64448 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gja3Q64448 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gja3Q64448 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
Gja3Q64448 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
Gja3Q64448 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
Gja3Q64448 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
Gja3Q64448 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gja3Q64448 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gja3Q64448 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gja3Q64448 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gja3Q64448 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gja3Q64448 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gja3Q64448 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gja3Q64448 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gja3Q64448 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gja3Q64448 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gja3Q64448 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gja3Q64448 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gja3Q64448 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gja3Q64448 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gja3Q64448 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gja3Q64448 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gja3Q64448 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gja3Q64448 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gja3Q64448 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gja3Q64448 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gja3Q64448 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gja3Q64448 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Gja3Q64448 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Gja3Q64448 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Gja3Q64448 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Gja3Q64448 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gja3Q64448 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gja3Q64448 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gja3Q64448 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gja3Q64448 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gja3Q64448 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gja3Q64448 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gja3Q64448 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gja3Q64448 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gja3Q64448 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gja3Q64448 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gja3Q64448 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gja3Q64448 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gja3Q64448 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gja3Q64448 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gja3Q64448 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gja3Q64448 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gja3Q64448 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gja3Q64448 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gja3Q64448 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gja3Q64448 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gja3Q64448 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gja3Q64448 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gja3Q64448 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gja3Q64448 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gja3Q64448 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gja3Q64448 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gja3Q64448 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gja3Q64448 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gja3Q64448 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gja3Q64448 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gja3Q64448 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gja3Q64448 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gja3Q64448 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gja3Q64448 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gja3Q64448 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gja3Q64448 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gja3Q64448 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gja3Q64448 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gja3Q64448 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gja3Q64448 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gja3Q64448 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gja3Q64448 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gja3Q64448 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gja3Q64448 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gja3Q64448 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gja3Q64448 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Gja3Q64448 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gja3Q64448 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Gja3Q64448 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gja3Q64448 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gja3Q64448 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gja3Q64448 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Gja3Q64448 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gja3Q64448 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gja3Q64448 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Gja3Q64448 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gja3Q64448 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gja3Q64448 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms