Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

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Length 994 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clcn1Q64347 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clcn1Q64347 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clcn1Q64347 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clcn1Q64347 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clcn1Q64347 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clcn1Q64347 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clcn1Q64347 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
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Clcn1Q64347 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clcn1Q64347 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clcn1Q64347 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clcn1Q64347 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clcn1Q64347 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clcn1Q64347 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clcn1Q64347 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
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Clcn1Q64347 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clcn1Q64347 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
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Clcn1Q64347 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clcn1Q64347 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
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Clcn1Q64347 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clcn1Q64347 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clcn1Q64347 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clcn1Q64347 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clcn1Q64347 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
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Clcn1Q64347 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clcn1Q64347 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
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Clcn1Q64347 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
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Clcn1Q64347 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clcn1Q64347 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
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Clcn1Q64347 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clcn1Q64347 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clcn1Q64347 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clcn1Q64347 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
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Clcn1Q64347 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Clcn1Q64347 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
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Clcn1Q64347 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clcn1Q64347 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clcn1Q64347 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clcn1Q64347 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clcn1Q64347 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
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