Protein–RNA interactions for Protein: Q640N1

Aebp1, Adipocyte enhancer-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aebp1Q640N1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Aebp1Q640N1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Aebp1Q640N1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Aebp1Q640N1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Aebp1Q640N1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Aebp1Q640N1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Aebp1Q640N1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Aebp1Q640N1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Aebp1Q640N1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Aebp1Q640N1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Aebp1Q640N1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Aebp1Q640N1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Aebp1Q640N1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Aebp1Q640N1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Aebp1Q640N1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Aebp1Q640N1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Aebp1Q640N1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Aebp1Q640N1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Aebp1Q640N1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Aebp1Q640N1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Aebp1Q640N1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Aebp1Q640N1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Aebp1Q640N1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Aebp1Q640N1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Aebp1Q640N1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Aebp1Q640N1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Aebp1Q640N1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Aebp1Q640N1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Aebp1Q640N1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Aebp1Q640N1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Aebp1Q640N1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Aebp1Q640N1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Aebp1Q640N1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Aebp1Q640N1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Aebp1Q640N1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Aebp1Q640N1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Aebp1Q640N1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Aebp1Q640N1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Aebp1Q640N1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Aebp1Q640N1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Aebp1Q640N1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Aebp1Q640N1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Aebp1Q640N1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Aebp1Q640N1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Aebp1Q640N1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Aebp1Q640N1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Aebp1Q640N1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Aebp1Q640N1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Aebp1Q640N1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Aebp1Q640N1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Aebp1Q640N1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Aebp1Q640N1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Aebp1Q640N1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Aebp1Q640N1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Aebp1Q640N1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Aebp1Q640N1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Aebp1Q640N1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Aebp1Q640N1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Aebp1Q640N1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Aebp1Q640N1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Aebp1Q640N1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Aebp1Q640N1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Aebp1Q640N1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Aebp1Q640N1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Aebp1Q640N1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Aebp1Q640N1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Aebp1Q640N1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Aebp1Q640N1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Aebp1Q640N1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Aebp1Q640N1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Aebp1Q640N1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Aebp1Q640N1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Aebp1Q640N1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Aebp1Q640N1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Aebp1Q640N1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Aebp1Q640N1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Aebp1Q640N1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Aebp1Q640N1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Aebp1Q640N1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Aebp1Q640N1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Aebp1Q640N1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Aebp1Q640N1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Aebp1Q640N1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Aebp1Q640N1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Aebp1Q640N1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Aebp1Q640N1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Aebp1Q640N1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Aebp1Q640N1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Aebp1Q640N1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Aebp1Q640N1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Aebp1Q640N1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Aebp1Q640N1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Aebp1Q640N1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Aebp1Q640N1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Aebp1Q640N1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Aebp1Q640N1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Aebp1Q640N1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Aebp1Q640N1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Aebp1Q640N1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Aebp1Q640N1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms