Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ccdc18Q640L5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ccdc18Q640L5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ccdc18Q640L5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ccdc18Q640L5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ccdc18Q640L5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ccdc18Q640L5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ccdc18Q640L5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ccdc18Q640L5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Ccdc18Q640L5 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ccdc18Q640L5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ccdc18Q640L5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ccdc18Q640L5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ccdc18Q640L5 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ccdc18Q640L5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Ccdc18Q640L5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ccdc18Q640L5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ccdc18Q640L5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ccdc18Q640L5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ccdc18Q640L5 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ccdc18Q640L5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ccdc18Q640L5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ccdc18Q640L5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ccdc18Q640L5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ccdc18Q640L5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ccdc18Q640L5 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ccdc18Q640L5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ccdc18Q640L5 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ccdc18Q640L5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ccdc18Q640L5 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Ccdc18Q640L5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ccdc18Q640L5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ccdc18Q640L5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ccdc18Q640L5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Ccdc18Q640L5 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Ccdc18Q640L5 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ccdc18Q640L5 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ccdc18Q640L5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Ccdc18Q640L5 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ccdc18Q640L5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ccdc18Q640L5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Ccdc18Q640L5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ccdc18Q640L5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ccdc18Q640L5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ccdc18Q640L5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ccdc18Q640L5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ccdc18Q640L5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ccdc18Q640L5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ccdc18Q640L5 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ccdc18Q640L5 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ccdc18Q640L5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ccdc18Q640L5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ccdc18Q640L5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ccdc18Q640L5 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ccdc18Q640L5 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ccdc18Q640L5 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ccdc18Q640L5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ccdc18Q640L5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ccdc18Q640L5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ccdc18Q640L5 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ccdc18Q640L5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ccdc18Q640L5 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ccdc18Q640L5 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ccdc18Q640L5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ccdc18Q640L5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ccdc18Q640L5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ccdc18Q640L5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ccdc18Q640L5 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ccdc18Q640L5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ccdc18Q640L5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ccdc18Q640L5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ccdc18Q640L5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ccdc18Q640L5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ccdc18Q640L5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ccdc18Q640L5 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Ccdc18Q640L5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ccdc18Q640L5 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ccdc18Q640L5 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ccdc18Q640L5 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ccdc18Q640L5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Ccdc18Q640L5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Ccdc18Q640L5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Ccdc18Q640L5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Ccdc18Q640L5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ccdc18Q640L5 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ccdc18Q640L5 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ccdc18Q640L5 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ccdc18Q640L5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ccdc18Q640L5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ccdc18Q640L5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ccdc18Q640L5 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Ccdc18Q640L5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ccdc18Q640L5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ccdc18Q640L5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ccdc18Q640L5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ccdc18Q640L5 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ccdc18Q640L5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Ccdc18Q640L5 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ccdc18Q640L5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ccdc18Q640L5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
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