Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PatjQ63ZW7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PatjQ63ZW7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PatjQ63ZW7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PatjQ63ZW7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PatjQ63ZW7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PatjQ63ZW7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PatjQ63ZW7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PatjQ63ZW7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PatjQ63ZW7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PatjQ63ZW7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PatjQ63ZW7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PatjQ63ZW7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PatjQ63ZW7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PatjQ63ZW7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PatjQ63ZW7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PatjQ63ZW7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PatjQ63ZW7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PatjQ63ZW7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PatjQ63ZW7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PatjQ63ZW7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PatjQ63ZW7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PatjQ63ZW7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PatjQ63ZW7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PatjQ63ZW7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PatjQ63ZW7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PatjQ63ZW7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PatjQ63ZW7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PatjQ63ZW7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PatjQ63ZW7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PatjQ63ZW7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PatjQ63ZW7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PatjQ63ZW7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PatjQ63ZW7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PatjQ63ZW7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PatjQ63ZW7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PatjQ63ZW7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PatjQ63ZW7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PatjQ63ZW7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PatjQ63ZW7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PatjQ63ZW7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PatjQ63ZW7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PatjQ63ZW7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PatjQ63ZW7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PatjQ63ZW7 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PatjQ63ZW7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PatjQ63ZW7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PatjQ63ZW7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PatjQ63ZW7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PatjQ63ZW7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PatjQ63ZW7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PatjQ63ZW7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PatjQ63ZW7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PatjQ63ZW7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PatjQ63ZW7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PatjQ63ZW7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PatjQ63ZW7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PatjQ63ZW7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PatjQ63ZW7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PatjQ63ZW7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PatjQ63ZW7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PatjQ63ZW7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PatjQ63ZW7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PatjQ63ZW7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PatjQ63ZW7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PatjQ63ZW7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PatjQ63ZW7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PatjQ63ZW7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PatjQ63ZW7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PatjQ63ZW7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PatjQ63ZW7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PatjQ63ZW7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PatjQ63ZW7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PatjQ63ZW7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PatjQ63ZW7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PatjQ63ZW7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PatjQ63ZW7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PatjQ63ZW7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PatjQ63ZW7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PatjQ63ZW7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PatjQ63ZW7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PatjQ63ZW7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PatjQ63ZW7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PatjQ63ZW7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PatjQ63ZW7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PatjQ63ZW7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PatjQ63ZW7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PatjQ63ZW7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PatjQ63ZW7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PatjQ63ZW7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PatjQ63ZW7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PatjQ63ZW7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PatjQ63ZW7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PatjQ63ZW7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PatjQ63ZW7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PatjQ63ZW7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PatjQ63ZW7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PatjQ63ZW7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PatjQ63ZW7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PatjQ63ZW7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms