Protein–RNA interactions for Protein: Q63955

Pou4f3, POU domain, class 4, transcription factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f3Q63955 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pou4f3Q63955 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pou4f3Q63955 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pou4f3Q63955 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pou4f3Q63955 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pou4f3Q63955 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pou4f3Q63955 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pou4f3Q63955 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pou4f3Q63955 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pou4f3Q63955 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pou4f3Q63955 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pou4f3Q63955 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pou4f3Q63955 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms