Protein–RNA interactions for Protein: Q62472

Lcn4, Vomeronasal secretory protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn4Q62472 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lcn4Q62472 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lcn4Q62472 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lcn4Q62472 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms