Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itga3Q62470 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Itga3Q62470 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga3Q62470 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga3Q62470 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga3Q62470 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga3Q62470 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga3Q62470 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga3Q62470 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga3Q62470 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga3Q62470 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itga3Q62470 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms