Protein–RNA interactions for Protein: Q62461

Gm20854, (clone BALB10N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20854Q62461 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
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Gm20854Q62461 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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Gm20854Q62461 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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Gm20854Q62461 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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Gm20854Q62461 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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Gm20854Q62461 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
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Gm20854Q62461 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
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Gm20854Q62461 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm20854Q62461 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
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Gm20854Q62461 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20854Q62461 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20854Q62461 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20854Q62461 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20854Q62461 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20854Q62461 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20854Q62461 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20854Q62461 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20854Q62461 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm20854Q62461 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20854Q62461 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20854Q62461 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20854Q62461 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20854Q62461 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20854Q62461 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20854Q62461 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20854Q62461 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20854Q62461 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20854Q62461 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20854Q62461 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20854Q62461 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20854Q62461 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20854Q62461 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20854Q62461 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm20854Q62461 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms