Protein–RNA interactions for Protein: Q62442

Vamp1, Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1Q62442 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp1Q62442 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp1Q62442 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms