Protein–RNA interactions for Protein: Q62425

Ndufa4, Cytochrome c oxidase subunit NDUFA4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa4Q62425 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ndufa4Q62425 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms