Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Sall3Q62255 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sall3Q62255 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sall3Q62255 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sall3Q62255 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sall3Q62255 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sall3Q62255 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sall3Q62255 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sall3Q62255 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sall3Q62255 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sall3Q62255 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sall3Q62255 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sall3Q62255 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Sall3Q62255 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sall3Q62255 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sall3Q62255 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sall3Q62255 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sall3Q62255 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sall3Q62255 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sall3Q62255 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sall3Q62255 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sall3Q62255 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sall3Q62255 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sall3Q62255 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Sall3Q62255 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sall3Q62255 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sall3Q62255 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sall3Q62255 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sall3Q62255 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sall3Q62255 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sall3Q62255 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sall3Q62255 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sall3Q62255 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sall3Q62255 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sall3Q62255 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sall3Q62255 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sall3Q62255 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sall3Q62255 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sall3Q62255 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sall3Q62255 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sall3Q62255 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sall3Q62255 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sall3Q62255 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Sall3Q62255 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sall3Q62255 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sall3Q62255 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sall3Q62255 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sall3Q62255 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sall3Q62255 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sall3Q62255 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Sall3Q62255 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sall3Q62255 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sall3Q62255 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Sall3Q62255 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Sall3Q62255 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Sall3Q62255 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
Sall3Q62255 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sall3Q62255 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Sall3Q62255 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sall3Q62255 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sall3Q62255 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sall3Q62255 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sall3Q62255 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sall3Q62255 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sall3Q62255 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sall3Q62255 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sall3Q62255 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sall3Q62255 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sall3Q62255 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sall3Q62255 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Sall3Q62255 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sall3Q62255 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sall3Q62255 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sall3Q62255 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sall3Q62255 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sall3Q62255 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sall3Q62255 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sall3Q62255 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sall3Q62255 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sall3Q62255 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sall3Q62255 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sall3Q62255 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sall3Q62255 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sall3Q62255 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sall3Q62255 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sall3Q62255 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sall3Q62255 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sall3Q62255 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sall3Q62255 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Sall3Q62255 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sall3Q62255 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sall3Q62255 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sall3Q62255 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sall3Q62255 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sall3Q62255 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sall3Q62255 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Sall3Q62255 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sall3Q62255 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sall3Q62255 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sall3Q62255 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms