Protein–RNA interactions for Protein: Q62249

Sox19, Protein SOX-19 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox19Q62249 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sox19Q62249 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms