Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Ttf1Q62187 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Ttf1Q62187 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
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Ttf1Q62187 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Ttf1Q62187 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ttf1Q62187 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Ttf1Q62187 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Ttf1Q62187 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Ttf1Q62187 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Ttf1Q62187 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Ttf1Q62187 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttf1Q62187 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttf1Q62187 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttf1Q62187 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttf1Q62187 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttf1Q62187 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
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Ttf1Q62187 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttf1Q62187 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttf1Q62187 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttf1Q62187 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttf1Q62187 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttf1Q62187 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttf1Q62187 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttf1Q62187 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ttf1Q62187 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttf1Q62187 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttf1Q62187 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttf1Q62187 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttf1Q62187 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttf1Q62187 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttf1Q62187 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttf1Q62187 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttf1Q62187 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttf1Q62187 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttf1Q62187 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttf1Q62187 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttf1Q62187 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ttf1Q62187 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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