Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Phox2aQ62066 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms