Protein–RNA interactions for Protein: Q62035

Ptafr, Platelet-activating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtafrQ62035 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PtafrQ62035 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtafrQ62035 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms