Protein–RNA interactions for Protein: Q61990

Pcbp2, Poly(rC)-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp2Q61990 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pcbp2Q61990 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pcbp2Q61990 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pcbp2Q61990 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pcbp2Q61990 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pcbp2Q61990 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pcbp2Q61990 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pcbp2Q61990 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pcbp2Q61990 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pcbp2Q61990 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pcbp2Q61990 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pcbp2Q61990 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pcbp2Q61990 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pcbp2Q61990 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pcbp2Q61990 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pcbp2Q61990 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pcbp2Q61990 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pcbp2Q61990 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Pcbp2Q61990 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pcbp2Q61990 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pcbp2Q61990 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pcbp2Q61990 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pcbp2Q61990 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pcbp2Q61990 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pcbp2Q61990 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pcbp2Q61990 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pcbp2Q61990 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pcbp2Q61990 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pcbp2Q61990 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pcbp2Q61990 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pcbp2Q61990 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pcbp2Q61990 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pcbp2Q61990 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pcbp2Q61990 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pcbp2Q61990 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pcbp2Q61990 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pcbp2Q61990 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pcbp2Q61990 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pcbp2Q61990 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Pcbp2Q61990 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pcbp2Q61990 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pcbp2Q61990 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pcbp2Q61990 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pcbp2Q61990 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pcbp2Q61990 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pcbp2Q61990 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Pcbp2Q61990 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pcbp2Q61990 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pcbp2Q61990 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pcbp2Q61990 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pcbp2Q61990 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pcbp2Q61990 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pcbp2Q61990 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pcbp2Q61990 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pcbp2Q61990 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pcbp2Q61990 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pcbp2Q61990 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pcbp2Q61990 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pcbp2Q61990 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pcbp2Q61990 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pcbp2Q61990 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pcbp2Q61990 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pcbp2Q61990 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pcbp2Q61990 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pcbp2Q61990 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pcbp2Q61990 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pcbp2Q61990 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pcbp2Q61990 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pcbp2Q61990 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pcbp2Q61990 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pcbp2Q61990 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pcbp2Q61990 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pcbp2Q61990 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pcbp2Q61990 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pcbp2Q61990 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pcbp2Q61990 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pcbp2Q61990 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pcbp2Q61990 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pcbp2Q61990 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pcbp2Q61990 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pcbp2Q61990 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pcbp2Q61990 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pcbp2Q61990 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pcbp2Q61990 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pcbp2Q61990 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pcbp2Q61990 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pcbp2Q61990 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pcbp2Q61990 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pcbp2Q61990 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pcbp2Q61990 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pcbp2Q61990 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pcbp2Q61990 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pcbp2Q61990 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pcbp2Q61990 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pcbp2Q61990 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pcbp2Q61990 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pcbp2Q61990 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pcbp2Q61990 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pcbp2Q61990 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pcbp2Q61990 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms