Protein–RNA interactions for Protein: Q61635

Ifi47, GTP-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi47Q61635 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ifi47Q61635 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ifi47Q61635 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms