Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Msi1Q61474 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Msi1Q61474 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Msi1Q61474 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Msi1Q61474 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Msi1Q61474 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Msi1Q61474 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Msi1Q61474 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Msi1Q61474 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Msi1Q61474 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Msi1Q61474 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Msi1Q61474 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Msi1Q61474 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Msi1Q61474 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Msi1Q61474 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Msi1Q61474 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Msi1Q61474 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Msi1Q61474 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Msi1Q61474 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Msi1Q61474 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Msi1Q61474 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Msi1Q61474 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Msi1Q61474 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Msi1Q61474 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Msi1Q61474 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Msi1Q61474 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Msi1Q61474 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Msi1Q61474 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Msi1Q61474 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Msi1Q61474 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Msi1Q61474 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Msi1Q61474 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Msi1Q61474 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Msi1Q61474 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Msi1Q61474 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Msi1Q61474 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Msi1Q61474 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Msi1Q61474 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Msi1Q61474 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Msi1Q61474 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Msi1Q61474 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Msi1Q61474 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Msi1Q61474 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Msi1Q61474 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Msi1Q61474 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Msi1Q61474 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Msi1Q61474 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Msi1Q61474 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Msi1Q61474 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Msi1Q61474 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Msi1Q61474 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Msi1Q61474 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Msi1Q61474 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Msi1Q61474 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Msi1Q61474 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Msi1Q61474 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Msi1Q61474 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Msi1Q61474 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Msi1Q61474 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Msi1Q61474 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Msi1Q61474 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Msi1Q61474 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Msi1Q61474 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Msi1Q61474 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Msi1Q61474 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Msi1Q61474 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Msi1Q61474 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Msi1Q61474 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Msi1Q61474 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Msi1Q61474 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Msi1Q61474 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Msi1Q61474 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Msi1Q61474 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Msi1Q61474 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Msi1Q61474 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Msi1Q61474 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Msi1Q61474 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Msi1Q61474 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Msi1Q61474 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Msi1Q61474 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Msi1Q61474 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Msi1Q61474 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msi1Q61474 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msi1Q61474 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msi1Q61474 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msi1Q61474 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msi1Q61474 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msi1Q61474 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msi1Q61474 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Msi1Q61474 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msi1Q61474 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msi1Q61474 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msi1Q61474 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msi1Q61474 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msi1Q61474 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msi1Q61474 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Msi1Q61474 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Msi1Q61474 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Msi1Q61474 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Msi1Q61474 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms