Protein–RNA interactions for Protein: Q61450

Gp49a, Mast cell surface glycoprotein Gp49A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp49aQ61450 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gp49aQ61450 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms