Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

Vsx2, Visual system homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx2Q61412 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vsx2Q61412 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vsx2Q61412 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vsx2Q61412 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vsx2Q61412 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vsx2Q61412 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vsx2Q61412 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vsx2Q61412 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vsx2Q61412 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vsx2Q61412 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vsx2Q61412 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vsx2Q61412 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vsx2Q61412 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vsx2Q61412 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vsx2Q61412 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vsx2Q61412 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Vsx2Q61412 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vsx2Q61412 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vsx2Q61412 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Vsx2Q61412 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vsx2Q61412 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vsx2Q61412 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vsx2Q61412 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vsx2Q61412 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vsx2Q61412 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vsx2Q61412 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vsx2Q61412 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vsx2Q61412 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vsx2Q61412 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vsx2Q61412 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vsx2Q61412 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vsx2Q61412 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vsx2Q61412 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vsx2Q61412 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vsx2Q61412 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Vsx2Q61412 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vsx2Q61412 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vsx2Q61412 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vsx2Q61412 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vsx2Q61412 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vsx2Q61412 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vsx2Q61412 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vsx2Q61412 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vsx2Q61412 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vsx2Q61412 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vsx2Q61412 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vsx2Q61412 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vsx2Q61412 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Vsx2Q61412 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vsx2Q61412 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vsx2Q61412 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vsx2Q61412 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vsx2Q61412 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vsx2Q61412 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vsx2Q61412 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vsx2Q61412 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vsx2Q61412 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vsx2Q61412 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vsx2Q61412 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vsx2Q61412 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vsx2Q61412 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vsx2Q61412 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vsx2Q61412 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vsx2Q61412 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vsx2Q61412 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vsx2Q61412 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vsx2Q61412 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vsx2Q61412 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vsx2Q61412 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vsx2Q61412 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vsx2Q61412 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vsx2Q61412 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vsx2Q61412 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vsx2Q61412 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vsx2Q61412 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Vsx2Q61412 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vsx2Q61412 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vsx2Q61412 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Vsx2Q61412 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vsx2Q61412 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vsx2Q61412 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vsx2Q61412 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vsx2Q61412 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vsx2Q61412 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vsx2Q61412 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vsx2Q61412 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vsx2Q61412 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vsx2Q61412 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vsx2Q61412 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vsx2Q61412 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vsx2Q61412 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vsx2Q61412 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vsx2Q61412 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vsx2Q61412 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vsx2Q61412 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vsx2Q61412 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vsx2Q61412 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vsx2Q61412 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vsx2Q61412 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vsx2Q61412 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms