Protein–RNA interactions for Protein: Q61290

Cacna1e, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, mousemouse

Predictions only

Length 2,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1eQ61290 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna1eQ61290 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna1eQ61290 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna1eQ61290 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna1eQ61290 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna1eQ61290 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna1eQ61290 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna1eQ61290 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacna1eQ61290 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacna1eQ61290 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacna1eQ61290 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacna1eQ61290 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacna1eQ61290 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacna1eQ61290 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacna1eQ61290 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacna1eQ61290 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacna1eQ61290 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacna1eQ61290 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacna1eQ61290 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cacna1eQ61290 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacna1eQ61290 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacna1eQ61290 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacna1eQ61290 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacna1eQ61290 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacna1eQ61290 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacna1eQ61290 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacna1eQ61290 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacna1eQ61290 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacna1eQ61290 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacna1eQ61290 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacna1eQ61290 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacna1eQ61290 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacna1eQ61290 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacna1eQ61290 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacna1eQ61290 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacna1eQ61290 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacna1eQ61290 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cacna1eQ61290 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cacna1eQ61290 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cacna1eQ61290 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cacna1eQ61290 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cacna1eQ61290 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cacna1eQ61290 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cacna1eQ61290 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cacna1eQ61290 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cacna1eQ61290 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cacna1eQ61290 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cacna1eQ61290 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cacna1eQ61290 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cacna1eQ61290 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cacna1eQ61290 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cacna1eQ61290 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cacna1eQ61290 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cacna1eQ61290 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cacna1eQ61290 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cacna1eQ61290 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cacna1eQ61290 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cacna1eQ61290 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cacna1eQ61290 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cacna1eQ61290 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cacna1eQ61290 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cacna1eQ61290 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cacna1eQ61290 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cacna1eQ61290 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cacna1eQ61290 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cacna1eQ61290 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cacna1eQ61290 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cacna1eQ61290 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cacna1eQ61290 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cacna1eQ61290 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cacna1eQ61290 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cacna1eQ61290 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cacna1eQ61290 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cacna1eQ61290 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cacna1eQ61290 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cacna1eQ61290 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cacna1eQ61290 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cacna1eQ61290 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cacna1eQ61290 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cacna1eQ61290 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cacna1eQ61290 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cacna1eQ61290 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cacna1eQ61290 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cacna1eQ61290 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cacna1eQ61290 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cacna1eQ61290 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cacna1eQ61290 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cacna1eQ61290 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cacna1eQ61290 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cacna1eQ61290 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cacna1eQ61290 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cacna1eQ61290 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cacna1eQ61290 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cacna1eQ61290 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cacna1eQ61290 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cacna1eQ61290 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacna1eQ61290 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacna1eQ61290 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacna1eQ61290 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacna1eQ61290 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms