Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klf3Q60980 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klf3Q60980 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms