Protein–RNA interactions for Protein: Q60960

Kpna1, Importin subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna1Q60960 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Kpna1Q60960 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms