Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DbpQ60925 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DbpQ60925 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DbpQ60925 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
DbpQ60925 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DbpQ60925 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DbpQ60925 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DbpQ60925 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DbpQ60925 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DbpQ60925 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DbpQ60925 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DbpQ60925 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DbpQ60925 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DbpQ60925 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DbpQ60925 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DbpQ60925 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DbpQ60925 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DbpQ60925 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DbpQ60925 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DbpQ60925 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DbpQ60925 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms