Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Traf3Q60803 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Traf3Q60803 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Traf3Q60803 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Traf3Q60803 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Traf3Q60803 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Traf3Q60803 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Traf3Q60803 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Traf3Q60803 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Traf3Q60803 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Traf3Q60803 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Traf3Q60803 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Traf3Q60803 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Traf3Q60803 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Traf3Q60803 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Traf3Q60803 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Traf3Q60803 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Traf3Q60803 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Traf3Q60803 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Traf3Q60803 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Traf3Q60803 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Traf3Q60803 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Traf3Q60803 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Traf3Q60803 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Traf3Q60803 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Traf3Q60803 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Traf3Q60803 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms