Protein–RNA interactions for Protein: Q60773

Cdkn2d, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor D, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2dQ60773 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdkn2dQ60773 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdkn2dQ60773 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdkn2dQ60773 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdkn2dQ60773 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdkn2dQ60773 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdkn2dQ60773 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdkn2dQ60773 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdkn2dQ60773 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdkn2dQ60773 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdkn2dQ60773 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdkn2dQ60773 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdkn2dQ60773 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdkn2dQ60773 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdkn2dQ60773 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdkn2dQ60773 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdkn2dQ60773 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdkn2dQ60773 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkn2dQ60773 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkn2dQ60773 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkn2dQ60773 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkn2dQ60773 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkn2dQ60773 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkn2dQ60773 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkn2dQ60773 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkn2dQ60773 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkn2dQ60773 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkn2dQ60773 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkn2dQ60773 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkn2dQ60773 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkn2dQ60773 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkn2dQ60773 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkn2dQ60773 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkn2dQ60773 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkn2dQ60773 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkn2dQ60773 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkn2dQ60773 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkn2dQ60773 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdkn2dQ60773 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cdkn2dQ60773 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cdkn2dQ60773 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cdkn2dQ60773 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cdkn2dQ60773 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkn2dQ60773 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms