Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Samhd1Q60710 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Samhd1Q60710 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Samhd1Q60710 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Samhd1Q60710 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Samhd1Q60710 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Samhd1Q60710 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Samhd1Q60710 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Samhd1Q60710 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Samhd1Q60710 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Samhd1Q60710 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Samhd1Q60710 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Samhd1Q60710 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Samhd1Q60710 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Samhd1Q60710 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Samhd1Q60710 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Samhd1Q60710 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Samhd1Q60710 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Samhd1Q60710 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Samhd1Q60710 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Samhd1Q60710 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Samhd1Q60710 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Samhd1Q60710 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Samhd1Q60710 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Samhd1Q60710 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Samhd1Q60710 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Samhd1Q60710 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Samhd1Q60710 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Samhd1Q60710 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Samhd1Q60710 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Samhd1Q60710 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Samhd1Q60710 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Samhd1Q60710 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Samhd1Q60710 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Samhd1Q60710 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Samhd1Q60710 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Samhd1Q60710 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Samhd1Q60710 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Samhd1Q60710 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Samhd1Q60710 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Samhd1Q60710 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Samhd1Q60710 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Samhd1Q60710 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Samhd1Q60710 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Samhd1Q60710 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Samhd1Q60710 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Samhd1Q60710 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Samhd1Q60710 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Samhd1Q60710 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Samhd1Q60710 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Samhd1Q60710 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Samhd1Q60710 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Samhd1Q60710 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Samhd1Q60710 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Samhd1Q60710 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Samhd1Q60710 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Samhd1Q60710 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Samhd1Q60710 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Samhd1Q60710 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Samhd1Q60710 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Samhd1Q60710 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Samhd1Q60710 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Samhd1Q60710 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Samhd1Q60710 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Samhd1Q60710 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Samhd1Q60710 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Samhd1Q60710 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Samhd1Q60710 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Samhd1Q60710 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Samhd1Q60710 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Samhd1Q60710 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Samhd1Q60710 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Samhd1Q60710 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Samhd1Q60710 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Samhd1Q60710 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Samhd1Q60710 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Samhd1Q60710 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Samhd1Q60710 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Samhd1Q60710 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Samhd1Q60710 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Samhd1Q60710 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Samhd1Q60710 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Samhd1Q60710 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Samhd1Q60710 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Samhd1Q60710 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Samhd1Q60710 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Samhd1Q60710 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Samhd1Q60710 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Samhd1Q60710 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Samhd1Q60710 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Samhd1Q60710 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Samhd1Q60710 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Samhd1Q60710 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Samhd1Q60710 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Samhd1Q60710 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Samhd1Q60710 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Samhd1Q60710 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Samhd1Q60710 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Samhd1Q60710 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Samhd1Q60710 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms