Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
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PtprnQ60673 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PtprnQ60673 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PtprnQ60673 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprnQ60673 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprnQ60673 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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PtprnQ60673 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
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PtprnQ60673 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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PtprnQ60673 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprnQ60673 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprnQ60673 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprnQ60673 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprnQ60673 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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PtprnQ60673 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprnQ60673 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprnQ60673 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprnQ60673 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprnQ60673 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprnQ60673 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprnQ60673 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprnQ60673 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprnQ60673 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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PtprnQ60673 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtprnQ60673 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtprnQ60673 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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PtprnQ60673 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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PtprnQ60673 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtprnQ60673 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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PtprnQ60673 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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PtprnQ60673 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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PtprnQ60673 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtprnQ60673 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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PtprnQ60673 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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PtprnQ60673 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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PtprnQ60673 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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PtprnQ60673 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtprnQ60673 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtprnQ60673 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtprnQ60673 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtprnQ60673 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtprnQ60673 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PtprnQ60673 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PtprnQ60673 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PtprnQ60673 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
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PtprnQ60673 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprnQ60673 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprnQ60673 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprnQ60673 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprnQ60673 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprnQ60673 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprnQ60673 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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