Protein–RNA interactions for Protein: Q60519

Sema5b, Semaphorin-5B, mousemouse

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Length 1,093 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5bQ60519 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sema5bQ60519 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sema5bQ60519 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sema5bQ60519 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sema5bQ60519 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Sema5bQ60519 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sema5bQ60519 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sema5bQ60519 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sema5bQ60519 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sema5bQ60519 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sema5bQ60519 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sema5bQ60519 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sema5bQ60519 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sema5bQ60519 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Sema5bQ60519 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sema5bQ60519 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Sema5bQ60519 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sema5bQ60519 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sema5bQ60519 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sema5bQ60519 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sema5bQ60519 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sema5bQ60519 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sema5bQ60519 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sema5bQ60519 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sema5bQ60519 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sema5bQ60519 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sema5bQ60519 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sema5bQ60519 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sema5bQ60519 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sema5bQ60519 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sema5bQ60519 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sema5bQ60519 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sema5bQ60519 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sema5bQ60519 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sema5bQ60519 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sema5bQ60519 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sema5bQ60519 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sema5bQ60519 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sema5bQ60519 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sema5bQ60519 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Sema5bQ60519 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sema5bQ60519 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sema5bQ60519 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sema5bQ60519 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sema5bQ60519 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sema5bQ60519 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sema5bQ60519 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sema5bQ60519 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sema5bQ60519 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sema5bQ60519 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sema5bQ60519 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sema5bQ60519 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sema5bQ60519 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Sema5bQ60519 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sema5bQ60519 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sema5bQ60519 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Sema5bQ60519 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sema5bQ60519 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sema5bQ60519 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sema5bQ60519 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sema5bQ60519 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sema5bQ60519 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sema5bQ60519 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Sema5bQ60519 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sema5bQ60519 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sema5bQ60519 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Sema5bQ60519 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sema5bQ60519 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sema5bQ60519 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sema5bQ60519 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sema5bQ60519 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Sema5bQ60519 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sema5bQ60519 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sema5bQ60519 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sema5bQ60519 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sema5bQ60519 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sema5bQ60519 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sema5bQ60519 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sema5bQ60519 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sema5bQ60519 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sema5bQ60519 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sema5bQ60519 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sema5bQ60519 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sema5bQ60519 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sema5bQ60519 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sema5bQ60519 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sema5bQ60519 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sema5bQ60519 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sema5bQ60519 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sema5bQ60519 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sema5bQ60519 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Sema5bQ60519 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sema5bQ60519 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sema5bQ60519 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Sema5bQ60519 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sema5bQ60519 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sema5bQ60519 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Sema5bQ60519 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sema5bQ60519 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sema5bQ60519 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms